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Delta突变株快速蔓延,你的疫苗和试剂盒能应对吗?

作者:北京百普赛斯生物科技股份有限公司 2021-09-23T16:00 (访问量:5415)

今年4月份印度疫情爆发后,新冠病毒Delta(B.1.617.2)突变株以惊人的速度在全球扩散。当前Delta变异株相关病例已占英国新冠新增确诊病例的99%,占葡萄牙新冠新增病例的96%,占美国新冠新增病例的10%,同时也在俄罗斯、德国、法国和西班牙等地快速传播(图1)。据世界卫生组织 (WHO) 专家透露,Delta变异株已传播至全球92个国家,正在成为全球主要流行的新冠毒株。其高传播力让专家们感到担忧,已被WHO列为“高度关注的变异株 (VOC,Variant of Concern)”。有研究表明,Delta变异株的传染性比首现于英国的Alpha变异株高出60%,而Alpha变异株比武汉最初出现的原始病毒株传染性高出50%。

图1. 英国2021.2.1—2021.6.7新冠突变株病例增长情况(紫色为Delta)

Delta变异株不仅传染性强,还具有一定的免疫逃逸能力。Moderna公司公布的新发布数据显示,在接种两剂mRNA-1273后,人体血清中针对Delta突变株的中和抗体滴度相较于D614G毒株下降了2.1倍;牛津大学发表的研究结果显示,阿斯利康疫苗AZD1222和辉瑞/BioNTech疫苗BNT162b2诱导的中和抗体对Delta的中和能力对比野生型分别下降了2.5倍 和4.3倍(图2)。

图2.辉瑞/BioNTech疫苗BNT162b2(左)和阿斯利康疫苗AZD1222(右)诱导的中和抗体对野生型新冠病毒和其他突变株(B.1.1.7, B.1.351, P.1, B.1.617.)的滴度(FRNT50)

除了快速扩散的Delta变异株,印度境内还发现两种B.1.617株系的变异株:B.1.617.1和B.1.617.3。根据WHO公布的信息,B.1.617.1(Kappa)变异株在特定地区表现出的传染性强于野生型毒株,但尚未引发大流行,且其致病性及免疫逃逸能力仍待评估,被WHO列为“值得关注的突变株 (VOI,Variant of Interest)“。目前只发现少数由B.1.617.3感染引发的确诊病例,因此这株变异毒株未被WHO列为VOC或VOI。(点击文末“相关阅读”,了解更多印度突变株信息)

Delta和Kappa变异株的Spike蛋白上均有多个突变位点,其中L452R和P681R突变位点相同,而其余突变位点存在差异; Delta变异株N蛋白上存在D63G, R203M和D377Y三个突变位点,Kappa变异株的N蛋白只有R203M和D377Y两个突变位点(3)。上述突变位点对变异毒株的传染性、致病性和免疫逃逸能力产生哪些影响,仍需要进行深入地研究。

图3. 新冠突变株Delta(B.1.617.2)和Kappa(B.1.617.1)Spike和N蛋白突变位点对比,颜色深代表该突变在蛋白序列中的出现频率高。

近期,英国卫生部报道了一种在Delta基础上产生的“Delta Plus”变异株。在已收集的序列中,“Delta Plus”变异株Spike蛋白RBD上除了L452R和T478K,还出现曾见于Beta突变株的K417N突变。这种突变病毒导致的确诊病例最早于今年2月在印度被发现,已被Pangolin分类为AY.1(B.1.617.2.1)或AY.2(B.1.617.2.2)。截止6月29日,全球有11个国家发现了200多例感染“Delta Plus”变异株的病例,这种兼具传染性极强的Delta变异株突变以及免疫逃逸能力较强的Beta变异株突变的“Delta Plus”新变异株已经引发了人们的警觉。

为支持对新冠病毒突变株的相关研究,ACROBiosystems已研发生产出Delta和Kappa突变株的一系列重组抗原蛋白,Delta plus产品也即将上线,包括突变Spike蛋白和N蛋白,该系列重组蛋白产品纯度高、生物活性好,适用于ELISA/SPR/BLI/Western blot/LFA等实验。
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>>>> Sars-Cov-2 spike RBD

Immobilized SARS-CoV-2 Spike RBD (L452R, T478K), His Tag (Cat. No. SPD-C52Hh) at 1 μg/mL (100 μL/well) can bind Human ACE2, Fc Tag (Cat. No. AC2-H5257) with a linear range of 0.2-3 ng/mL (QC tested).

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>>>> Sars-Cov-2 spike strimer

Immobilized SARS-CoV-2 Spike Trimer, His Tag (Cat. No. SPN-C52He) at 1 μg/mL (100 μL/well) can bind Human ACE2, Fc Tag (Cat. No. AC2-H5257) with a linear range of 0.2-2 ng/mL (QC tested).

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参考文献:

1.https://outbreak.info/compare-lineages?pango=B.1.617.2&pango=B.1.617.1&gene=N&gene=S&threshold=75

2.https://twitter.com/trvrb/status/1397195353284300800

3.https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/993879/Variants_of_Concern_VOC_Technical_Briefing_15.pdf

4.Moderna Provides a Clinical Update on the Neutralizing Activity of its COVID-19 Vaccine on Emerging Variants Including the Delta Variant First Identified in India (Jun 29, 2021). https://investors.modernatx.com/news-releases/news-release-details/moderna-provides-clinical-update-neutralizing-activity-its-covid

5.Wall E.C., Wu, M., Harvey, R., et al. AZD1222-induced neutralising antibody activity against SARS-CoV-2 Delta VOC (June 28, 2021). The Lancet. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(21)01462-8

6.Liu C., Ginn H.M., Dejnirattisai W. Reduced neutralization of SARS-CoV-2 B.1.617 by vaccine and convalescent serum. Cell, Articles in press. Available online 17 June 2021. https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.06.020

7.Kupferschmidt K., Wadman M. Delta variant triggers new phase in the pandemic (Jun 25, 2021). Science. Vol. 372, Issue 6549, pp. 1375-1376. DOI: 10.1126/science.372.6549.1375.

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